<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div class="gmail-copy-paste-block"><p><strong>PhD in Computational and Mathematical Neuroscience (EPSRC funded, 3.5 yrs, Sept 2019 start)</strong></p><p>  General information & apply (funding is primarily targeted at UK students):<br>       <a href="http://www.exeter.ac.uk/studying/funding/award/index.php?id=3386">http://www.exeter.ac.uk/studying/funding/award/index.php?id=3386</a></p><p>        Project description:<br>  <a href="http://www.exeter.ac.uk/codebox/phdprojects/Rankin-EPSRC-DTP-Project.pdf">http://www.exeter.ac.uk/codebox/phdprojects/Rankin-EPSRC-DTP-Project.pdf</a></p><p><b>Closing date <b> 7th </b>Jan 2019<br></b></p><p>
        This interdisciplinary project will develop computational and 
mathematical models of the auditory system to understand how complex 
stimuli like speech are encoded by spiking neurons in the midbrain.<br>   <br>
        The auditory midbrain is a key hub in the auditory processing pathway, 
functioning as an important junction that relays and shapes neural 
signals as they ascend towards auditory cortex.  Knowledge of the way in
 which complex sounds, e.g. speech, are encoded in the midbrain is 
crucial for understanding how dysfunction in the earlier auditory 
processing pathway (cochlea, auditory nerve, cochlear nucleus) leads to 
different types of hearing loss (a problem affecting 1 in 6 people in 
the UK). Working with neural recordings from the auditory midbrain in 
gerbils, a commonly-used animal for the study of low-frequency hearing, 
this project will develop mathematical and computational models of the 
auditory processing pathway. The aim is to understand the different 
roles of the patterns of inputs to midbrain neurons and their intrinsic 
response properties (e.g. their spiking rate) in shaping their responses
 to complex sounds.<br>   <br>      The project will use a dynamical systems 
approach to model the intrinsic properties of individual neurons in the 
midbrain in a biologically plausible way (working with, e.g. adaptive 
exponential integrate-and-fire neurons or the Hodgkin-Huxley equations).
 Inputs to these neurons will be based on established cochlear models 
and the biological details of the auditory nerve and cochlear nucleus. 
The resulting model will produce firing patterns directly comparable 
with neural recordings provided by the experimental supervisor. This 
data will be used to train and parameter fit the model using e.g. 
Bayesian optimisation or genetic algorithms. The resultant model will 
have explanatory power for the extent to which midbrain responses are 
shaped by its inputs from cochlear nucleus. Further, it will make 
predictions, testable in new experiments, of how midbrain responses will
 be affected by different dysfunctions of the early auditory system 
relating to hearing loss.<br>     <br>      The successful candidate will receive
 training dynamical systems theory and in the development and analysis 
of individual neuron and neural network models. An interdisciplinary 
approach, incorporating known biological details of the auditory 
processing pathway, will require the candidate to learn the relevant 
biology and neuroscience along with mathematical and computational 
techniques. The project will involve working closely with experimental 
neuroscientists and experimental data. This project provides a unique 
opportunity to receive training in mathematical modelling in close 
collaboration with experimentalists using cutting-edge methods recording
 spikes simultaneously from hundreds of neurons. Experience working on 
such interdisciplinary projects is highly sought after.<br>       <br>      
Candidates with quantitative backgrounds (mathematics, physics, 
engineering) and from neuroscience programmes are encouraged to apply. 
Programming experience, knowledge of dynamical systems theory and 
experience in biological modelling are a plus.</p><p>       For further information, please contact me at the email address above. <br></p><span><b>For further information, please contact Dr James Rankin, email <a href="mailto:j.a.rankin@exeter.ac.uk" target="_blank">j.a.rankin@exeter.ac.uk</a></b><br></span><div><a href="http://emps.exeter.ac.uk/mathematics/staff/jar226">http://emps.exeter.ac.uk/mathematics/staff/jar226</a><br></div><span></span><br></div></div></div>