<div dir="ltr">Dear all,<br><br>we would like to draw your attention to our two most recent papers and to two new software packages.<br><br><b>1. Two new papers:</b><br><br>This paper provides a detailed description of <b>SPIKY</b> (see 2.) and introduces our new measure <b>SPIKE-synchronization</b>:<br><br>•    Kreuz T, Mulansky M, Bozanic N:<br>     SPIKY: A graphical user interface for monitoring spike train synchrony.<br>     <a href="http://jn.physiology.org/content/113/9/3432">JNeurophysiol</a> 113, 3432 (2015) <a href="http://www.fi.isc.cnr.it/users/thomas.kreuz/images/Kreuz_JNeurophysiol_2015_SPIKY.pdf">[PDF]</a>.  <br><br><br>An overview of all three of our measures (<b>ISI-distance, SPIKE-distance and SPIKE-synchronization</b>) and their mathematical properties can be found in <br><br>•    Mulansky M, Bozanic N, Sburlea A, Kreuz T:<br>
     A guide to time-resolved and parameter-free measures of spike train synchrony.<br>
     IEEE Proceedings (in press) and <a href="http://arxiv.org/pdf/1502.02027v2.pdf">arXiv [PDF]</a> (2015).<br><br><br><b>2. SPIKY, graphical user interface (Matlab) for monitoring spike train synchrony</b><br><br>Implementations of ISI-distance, SPIKE-distance, and SPIKE-Synchronization<br>Distances, time profiles, distance matrices, selective averaging, triggered averages, dendrograms, etc.<br>Plotting, movie generation<br>Spike train generator, event detector (for continuous data such as EEG)<br>Matlab with C backend (MEX)<br>Matlab fallback if no MEX-compiler is not available<br>Extensive documentation includes many illustrative movies<br><br>Matlab source codes and all relevant papers are available on our<br><br><b>SPIKY download page</b><br><a href="http://www.fi.isc.cnr.it/users/thomas.kreuz/Source-Code/SPIKY.html">http://www.fi.isc.cnr.it/users/thomas.kreuz/Source-Code/SPIKY.html<br></a><br>For further information about new features and updates please check the<br><br><b>SPIKY Facebook page</b>           <a href="https://www.facebook.com/SPIKYgui">https://www.facebook.com/SPIKYgui</a><br><br>Here
 you'll also find a lot of documentation including many images and 
movies that illustrate how to use SPIKY. All of these movies can also be
 found on the<br><br><b>SPIKY Youtube channel</b>         <a href="https://www.youtube.com/user/SPIKYgui1">https://www.youtube.com/user/SPIKYgui1</a><br><br><br><b>3. PySpike, open source Python library hosted on github</b><br><br>Implementations of ISI-distance, SPIKE-distance, and SPIKE-Synchronization<br>Library of functions to compute distances and profiles (bivariate and multivariate),<br>distance matrices, selective averages, etc.<br>Helper functions for plotting, spike train generation<br>Cython backend for optimal performance (factor 100-200 over plain Python)
<br>Python fallback if Cython is not available
<br>Extensive unit-tests that cover the API as well as the numerics<br>
Automatic build and test runs<br>Documentation<br><br>The github issues system can be used to file bug reports or request new functionality and features.<br><br><b>PySpike webpage</b>         <a href="http://www.pyspike.de">http://www.pyspike.de</a><br>
<b>PySpike github page</b>    <a href="https://github.com/mariomulansky/PySpike">https://github.com/mariomulansky/PySpike</a><br><br>Any feedback on both the papers and the software packages is very welcome.<br><br>Best wishes,<br>Thomas Kreuz<br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Institute for complex systems, CNR<br>Via Madonna del Piano 10<br>50119 Sesto Fiorentino (Italy)<br>Tel: <span></span>+39-349-0748506<br>Email: <span></span><a href="mailto:thomas.kreuz@cnr.it" target="_blank">thomas.kreuz@cnr.it</a><br>Webpage:   <a rel="nofollow" href="http://www.fi.isc.cnr.it/users/thomas.kreuz/" target="_blank">http://www.fi.isc.cnr.it/users/thomas.kreuz/</a></div></div>
</div>