<div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px">"lumpers and splitters" I like that :).</span><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px">There is another aspect to this debate that I think is often overlooked.</span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px">Biological systems exhibit high degeneracy. </span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px">In this context, degeneracy refers to the ability of different mechanisms to produce the same function. This is to be contrasted with redundancy, which occurs</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px"> when similar mechanisms produce the same function. </span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px"> </span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px">See below for an excellent overview.</span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px">Degeneracy and Complexity in Biological Systems</span></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px">Gerald M. Edelman and Joseph A. Gally </span></font><br></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px">PNAS 2001</span></font></div><div><br></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px"><br></span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px">There may be large variability in the types of neurons in the cortex, but my bet is that their functions overlap - that is, this variability, in part, is an example of degeneracy. </span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px"><br></span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px">I'm interested in doing some simulations to develop this idea, if anyone is interested please feel free to email me.</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px"><br></span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px">Thanks,</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px"><br></span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="font-size:12.6666669845581px">Dror</span></font></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.6666669845581px"><br></span></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Nov 4, 2014 at 9:13 AM, Terry Sejnowski <span dir="ltr"><<a href="mailto:terry@salk.edu" target="_blank">terry@salk.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">The debate between lumpers and splitters on cortical areas will not be settled<br>
until we have the right tools to probe them anatomically and functionally.<br>
<br>
We don't even know how many types of neurons there are in the cortex.<br>
Estimates range from 100 to 1000.<br>
<br>
One of the goals of the BRAIN Initiative is to find out how many<br>
there are and how they vary between different parts of the cortex:<br>
<br>
<a href="http://www.braininitiative.nih.gov/2025/index.htm" target="_blank">http://www.braininitiative.nih.gov/2025/index.htm</a><br>
<br>
An important source of variability between neurons is differential patterns<br>
of gene methylation, which is uniquely different in neurons compared<br>
with other cell types in the body:<br>
<br>
Lister, R. Mukamel, et al.  Global epigenomic reconfiguration<br>
during mammalian brain development, Science, 341, 629, 2013<br>
<br>
<a href="http://directorsblog.nih.gov/2013/08/27/charting-the-chemical-choreography-of-brain-development/#more-1983" target="_blank">http://directorsblog.nih.gov/2013/08/27/charting-the-chemical-choreography-of-brain-development/#more-1983</a><br>
<br>
<a href="http://papers.cnl.salk.edu/PDFs/Global%20epigenomic%20reconfiguration%20during%20mammalian%20brain%20development%202013-4331.pdf" target="_blank">http://papers.cnl.salk.edu/PDFs/Global%20epigenomic%20reconfiguration%20during%20mammalian%20brain%20development%202013-4331.pdf</a><br>
<br>
We now have optical techniques to record from 1000 cortical neurons<br>
simultaneously and that will increase by a factor of 100-1000x<br>
over the next decade.<br>
<br>
This will create a big data problem for neuroscience that readers of<br>
this list could help solve:<br>
<br>
Sejnowski, T. J. Churchland, P.S. Movshon, J.A.<br>
Putting big data to good use in neuroscience,<br>
Nature Neuroscience, 17, 1440-1441, 2014<br>
<br>
<a href="http://papers.cnl.salk.edu/PDFs/Putting%20big%20data%20to%20good%20use%20in%20neuroscience%202014-4397.pdf" target="_blank">http://papers.cnl.salk.edu/PDFs/Putting%20big%20data%20to%20good%20use%20in%20neuroscience%202014-4397.pdf</a><br>
<br>
Terry<br>
<br>
-----<br>
</blockquote></div><br></div></div>