<div dir="ltr">Predrag,<div><br></div><div>I tested /opt/miniconda3-new on lov3. It works fine now.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Saswati</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Jun 15, 2020 at 5:54 PM Predrag Punosevac <<a href="mailto:predragp@andrew.cmu.edu">predragp@andrew.cmu.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Saswati Ray <<a href="mailto:sray@cs.cmu.edu" target="_blank">sray@cs.cmu.edu</a>> wrote:<br>
<br>
Hi Saswati and the rest of Autonians,<br>
<br>
Could you please test <br>
<br>
/opt/miniconda3-new<br>
<br>
and<br>
<br>
/opt/miniconda3-py38<br>
<br>
<br>
on LOV3. Note only LOV3 has two new instances of conda.<br>
<br>
miniconda3-new is the fresh installation of Python 3.7.7 which seems to<br>
fixes linking problem for me. <br>
<br>
miniconda3-py38 is python 3.8.3 which we probably should start using in<br>
the near future.<br>
<br>
Considering the pace of Python development and its importance for our<br>
lab I propose to have two miniconda installations per server (last two<br>
consequtive releases)<br>
<br>
/opt/miniconda-py37<br>
<br>
/opt/miniconda-py38<br>
<br>
I know that many people have their own installations of Conda which is<br>
not really optimal. If I get positive feed back I will go ahead and<br>
refresh miniconda installations on all nodes running RedHat 7.8.<br>
<br>
Cheers,<br>
Predrag<br>
<br>
<br>
<br>
> Thanks Predrag!<br>
> <br>
> On Mon, Jun 15, 2020 at 2:33 PM Predrag Punosevac <<a href="mailto:predragp@andrew.cmu.edu" target="_blank">predragp@andrew.cmu.edu</a>><br>
> wrote:<br>
> <br>
> > Saswati Ray <<a href="mailto:sray@cs.cmu.edu" target="_blank">sray@cs.cmu.edu</a>> wrote:<br>
> ><br>
> > > I cannot create a conda env on lov3. Which are the machines on which you<br>
> > > say are running RH 8.2 and are not affected?<br>
> > ><br>
> ><br>
> > Documentation?<br>
> ><br>
> > <a href="https://www.autonlab.org/intranet" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.autonlab.org/intranet</a><br>
> ><br>
> ><br>
> > lov[7-9] gpu[15-21]<br>
> ><br>
> > That is actually ten not eight machines as I wrote in my original email.<br>
> ><br>
> ><br>
> > > Thanks,<br>
> > > Saswati<br>
> > ><br>
> > > On Mon, Jun 15, 2020 at 1:48 PM Predrag Punosevac <<br>
> > <a href="mailto:predragp@andrew.cmu.edu" target="_blank">predragp@andrew.cmu.edu</a>><br>
> > > wrote:<br>
> > ><br>
> > > > Saswati Ray <<a href="mailto:sray@cs.cmu.edu" target="_blank">sray@cs.cmu.edu</a>> wrote:<br>
> > > ><br>
> > > > > Hi Predrag,<br>
> > > > ><br>
> > > > > >From today morning, I see this error in my pre-existing working<br>
> > conda<br>
> > > > > environment on lov3.<br>
> > > > ><br>
> > > ><br>
> > > > Damn Conda morons. I have seen that before. It looks like they broke<br>
> > > > Python 3.7.7 installation on RedHat 7.8. That is a linker problem you<br>
> > > > see. I just checked and I can still load python 3.7.7. but when I run a<br>
> > > > conda command I see the same error. We have 8 computing nodes in total<br>
> > > > running RedHat 8.2 and they are not affected. Please try to rebuild<br>
> > your<br>
> > > > environment and report. I will see later today if reinstalling can<br>
> > help.<br>
> > > > I am a moron too. I was contaplanting upgrading Python to 3.8.3. I<br>
> > > > should be much more careful with Conda guys.<br>
> > > ><br>
> > > > You also have RedHat rh-python36 in /opt/rh. That one always works.<br>
> > > ><br>
> > > > Predrag<br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > > > Traceback (most recent call last):<br>
> > > > >   File "recap.py", line 15, in <module><br>
> > > > >     import numpy as np<br>
> > > > >   File<br>
> > > > ><br>
> > > ><br>
> > "/zfsauton2/home/sray/.local/lib/python3.7/site-packages/numpy/__init__.py",<br>
> > > > > line 142, in <module><br>
> > > > >     from . import core<br>
> > > > >   File<br>
> > > > ><br>
> > > ><br>
> > "/zfsauton2/home/sray/.local/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/__init__.py",<br>
> > > > > line 102, in <module><br>
> > > > >     from . import _dtype_ctypes<br>
> > > > >   File<br>
> > > > ><br>
> > > ><br>
> > "/zfsauton2/home/sray/.local/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/_dtype_ctypes.py",<br>
> > > > > line 25, in <module><br>
> > > > >     import _ctypes<br>
> > > > > ImportError: libffi.so.7: cannot open shared object file: No such<br>
> > file or<br>
> > > > > directory<br>
> > > > ><br>
> > > > > Any ideas?<br>
> > > > ><br>
> > > > > Thanks,<br>
> > > > > Saswati<br>
> > > > ><br>
> > > > > --<br>
> > > > > Saswati Ray<br>
> > > > > Senior Research Analyst<br>
> > > > > Carnegie Mellon University - Auton Lab<br>
> > > > > Newell-Simon Hall Room 3115, Pittsburgh PA 15213<br>
> > > > > Phone: 412-268-1238<br>
> > > ><br>
> > ><br>
> > ><br>
> > > --<br>
> > > Saswati Ray<br>
> > > Senior Research Analyst<br>
> > > Carnegie Mellon University - Auton Lab<br>
> > > Newell-Simon Hall Room 3115, Pittsburgh PA 15213<br>
> > > Phone: 412-268-1238<br>
> ><br>
> <br>
> <br>
> -- <br>
> Saswati Ray<br>
> Senior Research Analyst<br>
> Carnegie Mellon University - Auton Lab<br>
> Newell-Simon Hall Room 3115, Pittsburgh PA 15213<br>
> Phone: 412-268-1238<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Saswati Ray<br>Senior Research Analyst<br>Carnegie Mellon University - Auton Lab<br>Newell-Simon Hall Room 3115, Pittsburgh PA 15213 <br>Phone: 412-268-1238<br></div></div></div></div>