<div dir="ltr">I'm not using Anaconda.<div><br></div><div>Unsure if this is related, but now also having issues with CUDA, too.</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Tue, Nov 6, 2018 at 5:33 PM Chirag Nagpal <<a href="mailto:chiragn@cs.cmu.edu" target="_blank">chiragn@cs.cmu.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Predrag: I am able to reproduce the error on the scratch directory too. <div><br></div><div>Vincent, Matt:  are you using the anaconda jupyter? it could be an anaconda upgrade thats responsible ?</div><div><br></div><div>Chirag</div></div><div class="gmail_extra"></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Nov 6, 2018 at 4:45 PM, Vincent Jeanselme <span dir="ltr"><<a href="mailto:vjeansel@andrew.cmu.edu" target="_blank">vjeansel@andrew.cmu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Even after changing my bashrc with export IPYTHONDIR=/home/scratch/$USER/.ipython and reinstalling my jupyter, it still does not seem to work. I also have an issue with git, I am no longer able to pull from the server.<div class="m_-4473238383930953489m_5142736628456964871HOEnZb"><div class="m_-4473238383930953489m_5142736628456964871h5"><br>
<br>
On 11/6/18 3:14 PM, Predrag Punosevac wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Matthew Barnes <<a href="mailto:mbarnes1@andrew.cmu.edu" target="_blank">mbarnes1@andrew.cmu.edu</a>> wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Also having this problem. Trying to create a new notebook hangs on<br>
"Creating new notebook in", and unable to open old notebooks. Anyone's<br>
setup currently working?<br>
<br>
</blockquote>
Jupyter Notebook is using sqlite database to store the info. Unless you<br>
explicitly force Jupyter to create the database on the scratch directory<br>
the database is stored on the NFS share. There is nothing worse one can<br>
do in terms of data consistency than put a database or a private Git<br>
repo (talking about the server) onto the NFS. The datebase was left in<br>
inconsistent state after the file server was rebooted. You have to clear<br>
it and possibly recreate the database to be able to use Jupyter<br>
Notebook.<br>
<br>
Best,<br>
Predrag<br>
<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
On Tue, Nov 6, 2018 at 12:44 PM Vincent Jeanselme <<a href="mailto:vjeansel@andrew.cmu.edu" target="_blank">vjeansel@andrew.cmu.edu</a>><br>
wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hello,<br>
<br>
Has anyone faced problems with running Jupyter Notebook since yesterday ?<br>
Did you remember what was the change to operate after the last reboot of<br>
the sqlite database ?<br>
<br>
Thank you,<br>
<br>
Vincent<br>
<br>
--<br>
Vincent Jeanselme<br>
-----------------<br>
Analyst Researcher<br>
Auton Lab - Robotics Institute<br>
Carnegie Mellon University<br>
<br>
<br>
</blockquote></blockquote></blockquote>
-- <br>
Vincent Jeanselme<br>
-----------------<br>
Analyst Researcher<br>
Auton Lab - Robotics Institute<br>
Carnegie Mellon University<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div></div><div class="gmail_extra">-- <br><div class="m_-4473238383930953489m_5142736628456964871gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span style="color:rgb(0,0,0)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><span><b>Chirag Nagpal<br></b>
Graduate Student, Language Technologies Institute<br>
School of Computer Science<br>
Carnegie Mellon University<br></span></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,0)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><span><a href="http://cs.cmu.edu/~chiragn" target="_blank">cs.cmu.edu/~chiragn</a><br></span></span></span></div></div></div></div></div></div>
</div></blockquote></div></div>